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2、精細(xì)胞與卵細(xì)胞產(chǎn)生方式與作用;
3、系統(tǒng)具體內(nèi)容以及各種系統(tǒng)的作用;
4、顯微鏡的具體組以及操作方式;
5、鑒定食物中含有淀粉、糖類、脂肪的主要方法及其操作步驟;
6、消化功能的含義以及具體功效;
7、人體的基本組織;
8、單細(xì)胞與多細(xì)胞的形態(tài)特征以及生命活動(dòng)特點(diǎn);
9、生物圈具體內(nèi)容以及功能作用;
中心法則作為分子生物學(xué)最基本、最重要的理論之一,對(duì)當(dāng)代分子生物學(xué)的發(fā)展起到了極大地推動(dòng)作用。然而,在分子生物學(xué)領(lǐng)域,自其產(chǎn)生到現(xiàn)在一直存在著很多爭議。作為一個(gè)科學(xué)假設(shè)的中心法則,對(duì)其進(jìn)行系統(tǒng)的語義分析有益于這一理論的意義澄清。那么在什么樣的一個(gè)基底上對(duì)其進(jìn)行語義分析?我們認(rèn)為這一基底應(yīng)該是語境論。
結(jié)構(gòu)學(xué)、生物化學(xué)和信息學(xué)路線是一直較為公認(rèn)的分子生物學(xué)研究中三條主要的路線。[1]中心法則的產(chǎn)生是以生化——信息學(xué)方法為基礎(chǔ)的。其產(chǎn)生的模式是假說演繹的,即先利用有限的證據(jù)提出一個(gè)假說,然后根據(jù)假說演繹出若干理論,最后等待證據(jù)檢驗(yàn)所演繹的結(jié)論,其過程是假說——演繹——檢驗(yàn)。伴隨著分子生物學(xué)的不斷發(fā)展,這一演繹——檢驗(yàn)的過程不斷循環(huán)往復(fù)。正是在這種循環(huán)往復(fù)的過程中,中心法則的語形發(fā)生著不斷地轉(zhuǎn)變。同時(shí),在此過程中,不斷有新的生物學(xué)概念的提出,不斷有新舊生物學(xué)概念的更替。在這里既包括新的概念的提出及其所被賦予的特定意義,又包括同一概念在不同的研究范圍中所包含的不同的生物學(xué)意義。也就是說,在這一過程中中心法則的語義不斷地發(fā)生變遷,而這種變遷是在分子生物學(xué)縱向語境的不斷變化中實(shí)現(xiàn)的。
1 中心法則的語義變遷
自克里克在1958年提出中心法則至今,中心法則已經(jīng)經(jīng)過了半個(gè)多世紀(jì)的豐富和發(fā)展。我們可以將其發(fā)展的整個(gè)過程大致分為三個(gè)階段:克里克最初提出的經(jīng)典的中心法則;20世紀(jì)70—80年代被修正和豐富的中心法則;20世紀(jì)末基因組及后基因組時(shí)代下的中心法則。
最初被克里克描述的中心法則如圖1所示。
圖1 最初被克里克描述的中心法則圖
箭頭表示在三大類生物大分子DNA、RNA和蛋白質(zhì)間信息傳遞或流動(dòng)所有可能的方向。它揭示了生命遺傳信息的流動(dòng)方向或傳遞規(guī)律。結(jié)合當(dāng)時(shí)的理論背景和認(rèn)識(shí)論背景,克里克對(duì)所描述的中心法則做了進(jìn)一步的分析,最終提出了中心法則最初的基本形式:
上式描述了由堿基→氨基酸→蛋白質(zhì)這一基本過程。對(duì)這一過程中代碼的語義分析,必然無法脫離整個(gè)理論的語義結(jié)構(gòu)。因?yàn)椋谝陨纤枋龅倪^程中,任意一次結(jié)構(gòu)的上升,都必然會(huì)伴隨著其代碼的語義調(diào)整。在中心法則中,堿基位于一個(gè)基礎(chǔ)的層面,成為生物學(xué)解釋與物理、化學(xué)解釋的紐帶。例如,在化學(xué)中GAA是作為氨基乙酸的代碼,然而,在生物學(xué)中,它卻表示對(duì)應(yīng)于谷氨酸的遺傳密碼。當(dāng)我們對(duì)其結(jié)構(gòu)上升,多個(gè)連續(xù)的三聯(lián)體堿基序列自然也就對(duì)應(yīng)多個(gè)連續(xù)的氨基酸序列。當(dāng)堿基序列發(fā)生變化時(shí),也就必然地導(dǎo)致氨基酸序列發(fā)生變化。有序列的堿基鏈和氨基酸鏈又分別構(gòu)成了DNA和蛋白質(zhì)。自此,就構(gòu)成了最初的中心法則:蛋白質(zhì)作為生物性狀形成的工作分子是由構(gòu)成DNA的堿基序列所決定,我們把這種堿基序列稱之為遺傳信息。同時(shí),由于當(dāng)時(shí)生物學(xué)理論背景及研究對(duì)象的限制,自然決定了中心法則從DNA到RNA到蛋白質(zhì)嚴(yán)格的單程信息流路線,以及從DNA序列到RNA序列到蛋白質(zhì)氨基酸序列嚴(yán)格的共線性。
由上可以得到,單一的堿基符號(hào)的語義形成是在中心法則整個(gè)的語義結(jié)構(gòu)中實(shí)現(xiàn)的,堿基序列在生物學(xué)語境中的語義表達(dá)同樣也無法脫離中心法則的語義結(jié)構(gòu)。而整個(gè)中心法則的語義實(shí)現(xiàn)又是在當(dāng)時(shí)特定的語境下完成。也就是說,特定語境的確立,決定了中心法則的語義解釋,確定了中心法則在當(dāng)時(shí)語境下的解釋伸縮度。
隨著分子生物學(xué)的發(fā)展,1970年Temin等在RNA病毒中發(fā)現(xiàn)了RNA逆轉(zhuǎn)錄酶,說明了RNA到DNA逆向轉(zhuǎn)錄的可能性。[2]之后,又有人發(fā)現(xiàn)細(xì)胞核里的DNA還可以直接轉(zhuǎn)譯到細(xì)胞質(zhì)的核糖體上,不需要通過RNA即可以控制蛋白質(zhì)的合成。[3]此時(shí),中心法則被修正為如圖2所示。
圖2 修正后的中心法則圖
而中心法則的語義解釋,也就由之前的“嚴(yán)格的單程式”變遷為一種“中途單程式”。從20世紀(jì)70年代開始,分子生物學(xué)家對(duì)真核生物進(jìn)行了大量的研究,發(fā)現(xiàn)了基因上存在的非編碼序列,從而產(chǎn)生了內(nèi)含子與外顯子的區(qū)別。20世紀(jì)80年代末,分子生物學(xué)家又報(bào)道了多種RNA編輯的類型。這些都說明了蛋白質(zhì)序列在DNA序列上的非連續(xù)性及非對(duì)應(yīng)性。這又要求中心法則的語義解釋由之前的“嚴(yán)格共線性”轉(zhuǎn)變?yōu)?ldquo;非共線性”。這都是由于分子生物學(xué)縱向語境的變化,導(dǎo)致了中心法則語義邊界的改變,從而使其語義的解釋范圍及解釋伸縮度發(fā)生改變。理論背景及認(rèn)識(shí)論背景的不同,便造成了中心法則概念的語義擴(kuò)張。這種語義的擴(kuò)張通過再語境化的功能,繼而又成為其它生物學(xué)理論的語義語境。中心法則的理論發(fā)展,就是在這種語境轉(zhuǎn)變,或者說是再語境化的過程中不斷實(shí)現(xiàn)其語義轉(zhuǎn)變。
在分子生物學(xué)中,還有非DNA分子模板(如細(xì)胞模板、糖原以及一些細(xì)胞級(jí)的非分子模板)、朊病毒等的出現(xiàn)。雖然,這些只是出現(xiàn)在離體實(shí)驗(yàn)中,應(yīng)只屬于尚未定論的科學(xué)預(yù)測。但是,它們強(qiáng)力說明著:在生物系統(tǒng)中,信息流的傳遞是多元和多層次的,它們?cè)诩?xì)胞中構(gòu)成了一個(gè)精密的時(shí)空框架,中心法則僅僅只是這些信息流中的一條或者說是一條主流;在中心法則的信息流中,非DNA編碼的滲入,使得DNA僅作為DNA編碼的一個(gè)起點(diǎn),而不是遺傳信息流的唯一源頭;同時(shí),在信息流的傳遞過程中,非模板式的序列加工,使得信息流并不是模板流。[4]這些似乎對(duì)中心法則都構(gòu)成了嚴(yán)峻的挑戰(zhàn)。然而,我們并不能抹殺它的合理性地位。中心法則的提出是以當(dāng)時(shí)病毒、細(xì)菌的實(shí)驗(yàn)材料為依據(jù)。它所指出的DNA、RNA、蛋白質(zhì)間的信息傳遞是符合分子生物法則的。鑒于當(dāng)時(shí)理論背景和認(rèn)識(shí)論背景的限制,我們應(yīng)該是在其三大分子的框架性語境下對(duì)其進(jìn)行語義解釋。當(dāng)分子生物學(xué)推進(jìn)到真核細(xì)胞時(shí),中心法則的信息流其實(shí)已經(jīng)處于另一個(gè)完全不同的時(shí)空框架中,這時(shí)我們應(yīng)對(duì)其進(jìn)行語境下降,在單個(gè)基因?qū)用婊蛘呤歉偷膶用鎸?duì)其進(jìn)行語義解釋。而面對(duì)當(dāng)代基因組語義研究的問題,或許我們還要對(duì)其進(jìn)行語境上升,在基因組層面、細(xì)胞層面甚至是更高的層面對(duì)其進(jìn)行語義解釋。
綜上所述,對(duì)中心法則的語義解釋應(yīng)該放在分子生物學(xué)發(fā)展的縱向語境下進(jìn)行。中心法則的語義變遷就是在這一縱向發(fā)展過程中,一次次不斷地語境化與再語境化的過程中實(shí)現(xiàn)的。同時(shí),我們對(duì)中心法 則的語義理解也還必須在一種橫向的特定的語境下進(jìn)行,而不是僅僅只在分子生物信息較窄的概念下進(jìn)行。只有這樣才不會(huì)導(dǎo)致中心法則的語義局限性。而作為科學(xué)理論的中心法則語義被局限,自然會(huì)導(dǎo)致其作為研究方法的意義局限性。這也就引出了本文接下來所要談?wù)摰囊粋€(gè)問題:在傳統(tǒng)意義下,作為研究方法的中心法則的意義及其局限性。
2 作為研究方法的中心法則的意義及其局限性
中心法則是一個(gè)關(guān)于DNA、RNA、蛋白質(zhì)三大分子的信息傳遞的科學(xué)理論。在它的解釋之下,信息不能由蛋白質(zhì)向下傳遞到DNA,而是DNA被轉(zhuǎn)錄成RNA,RNA再翻譯成蛋白質(zhì)。更進(jìn)一步講是,“信息從DNA向上傳遞到RNA、蛋白質(zhì),進(jìn)而延伸到細(xì)胞、多細(xì)胞系統(tǒng)”。[5]然而,不僅于此,中心法則還作為一種研究的方法,被用于許多研究計(jì)劃,用以解決基因組的語義問題。
基因組研究的核心問題是研究作為生命系統(tǒng)發(fā)展和運(yùn)行基礎(chǔ)的基因組調(diào)節(jié)網(wǎng)絡(luò)的意義。一個(gè)基因組意義的理論問題便是一個(gè)基因組語義問題。部分地講,這種語義是將基因組序列轉(zhuǎn)化成系統(tǒng)性意義的語義代碼。由于生物系統(tǒng)是在不同層次被組織,所以一個(gè)基因組的語義會(huì)由于該序列片段所處的本體論、功能及組織層次的不同而產(chǎn)生不同的語義聯(lián)想意義。因此,如何獲得一個(gè)基因組語義的元理論問題便成為基因組和蛋白質(zhì)組研究的戰(zhàn)略問題。
目前,許多關(guān)于基因組研究的方法論都是遵循一種自下而上的策略。這種研究的方法正是受到了中心法則的啟示。也就是說,中心法則為還原論者研究基因組提供了方法論基礎(chǔ)。這種還原論方法論的前提是,在我們要進(jìn)一步了解下一個(gè)層次的信息時(shí),我們必須在理論上和實(shí)際中都要對(duì)每一個(gè)更低、更微觀層面的信息和本體論的知識(shí)有所把握。這就好比說,當(dāng)我們要獲得一個(gè)蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)時(shí),我們首先要掌握構(gòu)成這一蛋白質(zhì)的氨基酸信息,再獲得核酸信息。然而,即便是掌握了基本的核酸信息,由于基因和細(xì)胞網(wǎng)絡(luò)設(shè)計(jì)一系列的相互作用的部分,而使得從核酸到蛋白質(zhì)信息的過程特別復(fù)雜。
一個(gè)以中心法則為方法的研究項(xiàng)目,最大的弱點(diǎn)是其驚人的復(fù)雜度。這種自下而上的還原論策略存在的問題是,尋找到一個(gè)解決路徑的搜索空間非常巨大。在計(jì)算機(jī)科學(xué)中,解決一個(gè)問題的關(guān)鍵往往就在于能夠解決這個(gè)問題的可能路徑的空間。這樣一系列的可能路徑被稱為搜索空間。一個(gè)問題的一種解決方法就是一個(gè)路徑在這樣一種搜索空間中實(shí)現(xiàn)一個(gè)目標(biāo)或解決。一些問題擁有巨大的搜索空間,從而使得其在實(shí)際層面上幾乎不可能被解決。在計(jì)算機(jī)科學(xué)中講,這就是所謂的NP——complete問題。[6]這些問題的復(fù)雜程度,足以使現(xiàn)階段最快的計(jì)算機(jī)癱瘓。基因組和細(xì)胞網(wǎng)絡(luò)的研究正是面臨這樣的問題,它們涉及成千上萬的相互作用的部分。遵循一種自下而上的策略進(jìn)行研究,必然在其過程中呈現(xiàn)出一系列的NP——complete問題。
然而,在實(shí)際的研究過程中,研究者形成的研究策略都是依據(jù)關(guān)于更高層次的生物信息的知識(shí)。“即使在平常的實(shí)驗(yàn)決策和實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)中,研究者的行為都是在一個(gè)關(guān)于現(xiàn)象的系統(tǒng)知識(shí),即一個(gè)更高層次的語境中進(jìn)行的。”[7]在這些系統(tǒng)問題的研究過程中,研究者預(yù)先假設(shè)這些知識(shí)可以對(duì)他的研究和實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)提供一個(gè)更寬的方向。更為重要的是,這樣就使得這個(gè)研究有了其自身的意義。這種高層次、系統(tǒng)性的信息給出了這個(gè)研究或?qū)嶒?yàn)為什么要進(jìn)行的理由。
這種知識(shí)在人工智能的研究領(lǐng)域被稱為啟發(fā)性知識(shí)。啟發(fā)性知識(shí)被定義為可以減少搜索空間的信息。因此,在這種情況下,科學(xué)家就利用這種啟發(fā)性的、系統(tǒng)層面的生物學(xué)知識(shí),去減少那些非正式的、直覺的、先驗(yàn)的搜索空間,從而來解決他的問題。在我們所說的基因組語義的問題中,啟發(fā)性信息可以減少基因組語義的搜索空間,可以減少基因代碼可能解釋的空間。
例如,在信息的傳遞方面,根據(jù)中心法則,信息是不能從蛋白質(zhì)到RNA再到DNA向下傳遞的。然而,在系統(tǒng)層面,信息可以從蛋白質(zhì)向下傳遞到DNA。細(xì)胞信號(hào)就是一個(gè)例子。正是由于一系列的蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)的相互作用,蛋白質(zhì)與RNA的相互作用,導(dǎo)致了DNA轉(zhuǎn)錄的被激活。因此,從系統(tǒng)層面來講,中心法則僅僅介紹了細(xì)胞信息系統(tǒng)中許多種可能的信息傳遞路徑中的一種。實(shí)際上,存在細(xì)胞內(nèi)的信息傳遞路徑和細(xì)胞間的信息傳遞路徑。這些路徑構(gòu)成了細(xì)胞內(nèi)及細(xì)胞間的信息傳遞網(wǎng)。然而,它們又都是通過細(xì)胞的基因組信息來組織著細(xì)胞內(nèi)和細(xì)胞間的信息傳遞。
所以,我們必須有意識(shí)地去區(qū)分作為科學(xué)理論的中心法則和作為研究的方法的中心法則。否則,我們就有可能錯(cuò)誤地提前認(rèn)為,由于信息不能向下傳遞,我們就不能自上而下地由高層次的信息得到低層次的信息。多細(xì)胞以及單細(xì)胞中信息傳遞的二元性,就使得基因組語義的研究策略,跳出了傳統(tǒng)意義下中心法則的局限性。
現(xiàn)階段關(guān)于基因組理論的大部分研究,都是遵循傳統(tǒng)意義下的中心法則,在一個(gè)嚴(yán)格的自下而上研究策略下進(jìn)行的。替代這種研究策略,我們主張同時(shí)考慮一種自上而下的互補(bǔ)性策略。我們認(rèn)為,一種能夠整合高層面的系統(tǒng)層面與低層面的基因組信息層面的研究策略,對(duì)于解決基因組語義問題是非常必要的。傳統(tǒng)意義下的中心法則對(duì)于基因組語義研究已經(jīng)不再是充足的組織模式。那么是否存在一種路徑,在細(xì)胞和多細(xì)胞的語境下,利用高層次的系統(tǒng)信息去理解基因組?我們認(rèn)為是存在的。正如上文所言,這時(shí)候我們就需要對(duì)傳統(tǒng)意義下的中心法則進(jìn)行語境上升,在細(xì)胞與多細(xì)胞的層面對(duì)其進(jìn)行語義理解。同時(shí),在方法論層面,我們也就同樣可以嘗試一種自上而下的研究范式,來補(bǔ)充之前的嚴(yán)格的自下而上的方法論研究策略。
3 中心法則方法論意義研究的新路徑
什么是一個(gè)自上而下的研究策略?
在一個(gè)自上而下的研究策略下,我們可以在抽象概念的層面來討論多細(xì)胞的發(fā)展過程。在抽象概念層面的討論,可以使我們獲得更多關(guān)于系統(tǒng)層面的現(xiàn)象。假設(shè)有一個(gè)軟件系統(tǒng),并且在這個(gè)軟件系統(tǒng)中可以設(shè)計(jì)一個(gè)人工基因組,同時(shí)在這個(gè)系統(tǒng)中該基因組可以產(chǎn)生一個(gè)人工有機(jī)體。然后,我們可以使這個(gè)人工基因組盡可能地模仿自然基因組的主要的系統(tǒng)屬性。比如,該系統(tǒng)是否能夠模擬多細(xì)胞的發(fā)展、細(xì)胞信號(hào)的傳遞等?在該系統(tǒng)中進(jìn)行特定位點(diǎn)的基因突變,是否能得到自然基因組下的相似效果,如畸形發(fā)展、癌變等?這一系列問題的實(shí)現(xiàn),就 使得我們可以確認(rèn)該系統(tǒng)能夠反映自然基因組的一些基本特征。然而,我們可能需要一種更為精確的相關(guān)性。但是,如果我們能夠使得人工基因組與自然基因組相關(guān)聯(lián),那么我們就得到了從一個(gè)基因組翻譯到另一個(gè)基因組的開端。如圖3所示。
圖3 基因組翻譯模擬圖
圖3所模擬的是生物體內(nèi)的基因組和計(jì)算機(jī)系統(tǒng)中多細(xì)胞有機(jī)體之間的關(guān)系。圖中的“翻譯關(guān)系”指的是計(jì)算機(jī)系統(tǒng)及生物體系統(tǒng)中基因組之間的“句法關(guān)系”。中間的“語義關(guān)系”表示的是用計(jì)算機(jī)系統(tǒng)中的多細(xì)胞有機(jī)體語言翻譯出生物體中的基因組。下面的“一致性關(guān)系”應(yīng)該包括系統(tǒng)之間暫時(shí)的和動(dòng)態(tài)的形態(tài)學(xué)之間的一致性。
這就好比將英語翻譯成漢語。我們需要知道這些被翻譯的單詞是什么,如何在句子中使它們相關(guān)聯(lián)。這就是語言中的句法。但是,首先我們需要知道語言的語義。也只有當(dāng)兩段話的意思相同的時(shí)候,對(duì)于一個(gè)詞、一句話或者一段話的翻譯才是充分的。
這樣我們就通過計(jì)算機(jī)代碼的語義獲得了基因組的語義。然而,在這個(gè)過程中,并不妨礙我們同時(shí)使用自下而上的研究策略。“在人工智能中,合并自上而下和自下而上的研究路徑是較優(yōu)的研究策略之一。當(dāng)兩種研究路徑,分別自上而下與自下而上在中間合并時(shí),便形成了一種解決路徑。”[8]
在這里需要注意的是,無論是低層次的本體論層面(如生物化學(xué)),還是高層次的關(guān)于信息和本體論的層面,對(duì)于研究生物過程而言,沒有哪一種是固有的更為優(yōu)越的。關(guān)于細(xì)胞和多細(xì)胞現(xiàn)象的正確的高層面的信息,沒有必要一定要被還原成更低層面的本體論視角。很多情況下,高層面的系統(tǒng)知識(shí)反而能夠幫助我們限定研究的搜索空間,促進(jìn)我們?nèi)ダ斫飧蛯用娴纳镞^程。因此,對(duì)于一個(gè)系統(tǒng)不同層面信息的理解,能夠使我們獲得更多、更全面的關(guān)于該系統(tǒng)的知識(shí)。
所以,在細(xì)胞或者多細(xì)胞系統(tǒng)的層面,中心法則可以被簡單的描述為:基因組→蛋白質(zhì)組。我們也沒有必要必須將其還原到DNA轉(zhuǎn)錄和翻譯的層面。
4 結(jié)語
隨著分子生物學(xué)的發(fā)展,其理論在不斷地遠(yuǎn)離經(jīng)驗(yàn)。在這樣的一個(gè)背景下,如何去構(gòu)造、理解和解釋分子生物學(xué),語義分析成為一種十分重要的科學(xué)方法。首先,“語義分析方法本身作為語義學(xué)方法論,在科學(xué)哲學(xué)中的運(yùn)用是‘中性’的,這個(gè)方法本身并不必然地導(dǎo)向?qū)嵲谡摶蚍磳?shí)在論,而是為某種合理的科學(xué)哲學(xué)的立場提供有效的方法論的論證。”[9]“語義分析方法在例如科學(xué)實(shí)在論等傳統(tǒng)問題的研究上具有超越性,在一個(gè)整體語境范圍內(nèi)其方法更具基礎(chǔ)性;其次,作為科學(xué)表述形式的規(guī)則與其理論自身架構(gòu)是息息相關(guān)的,這種關(guān)聯(lián)充分體現(xiàn)在理論表述的語義結(jié)構(gòu)之上,對(duì)其邏輯合理性的分析就是對(duì)理論真理性的最佳驗(yàn)證;第三,生物學(xué)理論表述的多元化特征使得語義分析應(yīng)用更加具有靈活性。”[10]
正如中心法則,其語義的實(shí)現(xiàn)無法脫離其整個(gè)理論的語義結(jié)構(gòu)。在整個(gè)理論中,每一次結(jié)構(gòu)的上升或者下降,都會(huì)帶來其代碼的語義調(diào)整。同時(shí),生物體是一個(gè)多層次的、有組織的、結(jié)構(gòu)復(fù)雜的系統(tǒng),在這個(gè)不同層次被組織的復(fù)雜系統(tǒng)中,任何一個(gè)代碼的語義都會(huì)由于其指稱實(shí)體所處的本體論、功能及組織層次的不同,而產(chǎn)生不同的語義聯(lián)想意義。因此,對(duì)中心法則進(jìn)行語義研究是有益于其意義澄清及理論分析的。然而,這種語義研究應(yīng)該在分子生物學(xué)發(fā)展的縱向語境下進(jìn)行。因?yàn)椋行姆▌t的語義變遷正是在分子生物學(xué)縱向發(fā)展的語境化與再語境化得過程中實(shí)現(xiàn)的。同時(shí),我們也只有在某種特定的語境下對(duì)中心法則進(jìn)行語義解釋,才不會(huì)導(dǎo)致其語義的局限性。
關(guān)鍵詞:印染廢水 好氧生物處理 微生物菌群變化
1.前言
印染行業(yè)是工業(yè)廢水排放大戶,據(jù)不完全統(tǒng)計(jì),全國印染廢水每天排放量為3×106~4×106m3。印染廢水具有水量大、有機(jī)污染物含量高、色度深、堿性大、水質(zhì)變化大等特點(diǎn),屬難處理的工業(yè)廢水。目前,國內(nèi)的印染廢水處理手段以生化法為主,有的還將化學(xué)法與之串聯(lián)。生物接觸氧化法是一種介于活性污泥法與生物濾池之間的生物膜法工藝,其特點(diǎn)是在池內(nèi)設(shè)置填料,池底曝氣對(duì)污水進(jìn)行充氧,并使池體內(nèi)污水處于流動(dòng)狀態(tài),以保證污水同浸沒在污水中的填料充分接觸,避免生物接觸氧化池中存在污水與填料接觸不均的缺陷。生物接觸氧化法中微生物所需的氧常通過鼓風(fēng)曝氣供給,生物膜生長至一定厚度后,近填料壁的微生物由于缺氧而進(jìn)行厭氧代謝,產(chǎn)生的氣體及曝氣形成的沖刷作用會(huì)造成生物膜的脫落,并促進(jìn)新生物膜的生長,形成生物膜的新陳代謝,脫落的生物膜將隨出水流出池外
本項(xiàng)目廢水采用“絮凝沉淀+水解酸化+接觸氧化”處理工藝,通過水質(zhì)監(jiān)測和調(diào)試過程中環(huán)境的變化對(duì)好氧生化池中生物相的變化進(jìn)行了分析和研究,以為工程調(diào)試提供幫助。
2.工程簡介
2.1 設(shè)計(jì)水量
處理水量:1200m3/d。
處理能力:50m3/h(以24h計(jì))。
2.2 處理水質(zhì)
進(jìn)水水質(zhì):pH=5~6.5,ρ(CODcr)= 600~800mg/L,ρ(BOD5)=100~400 mg/L,ρ(SS)=100~200 mg/L,色度100~400倍。
出水水質(zhì):執(zhí)行《紡織染整工業(yè)水污染物排放標(biāo)準(zhǔn)》(GB4287-92)3中Ⅰ級(jí)標(biāo)準(zhǔn):ρ(CODcr) 100 mg/L,ρ(BOD5) 25 mg/L,ρ(SS) 70 mg/L,色度40倍。
2.3 工藝流程
廢水處理工藝流程見圖1。
3.廢水微生物概述
3.1 主要微生物
在好氧生物處理系統(tǒng)中的微生物主要是細(xì)菌(包括真菌),其它還有藻類、原生動(dòng)物等微型動(dòng)物。
在廢水好氧生物處理過程中,去除含碳有機(jī)物起主要作用的是異氧菌,數(shù)量最多的也是異氧菌。真菌為多細(xì)胞異氧微生物,為嚴(yán)格好氧,喜歡酸性環(huán)境(最佳pH約5.6),需氧量低。
單細(xì)胞原生生物如原生動(dòng)物和多細(xì)胞后生動(dòng)物如微型動(dòng)物輪蟲在廢水處理過程中也起主要的作用。這些微生物以小的膠體有機(jī)顆粒和分散的細(xì)菌細(xì)胞為食料,可減少生物處理系統(tǒng)出水的濁度。原生動(dòng)物和后生動(dòng)物的種類多少、生長情況和數(shù)量被用來評(píng)價(jià)生物系統(tǒng)是否正常。當(dāng)原生動(dòng)物種類多、生長好、數(shù)量多并出現(xiàn)后生動(dòng)物時(shí),一般認(rèn)為廢水處理系統(tǒng)處理情況良好,運(yùn)行正常的象征。
必須指出,新生的微生物細(xì)菌,是一種不穩(wěn)定的有機(jī)物,呈懸浮固體狀,易于分離。好氧生物處理的實(shí)質(zhì)時(shí)廢水中的溶解性有機(jī)物轉(zhuǎn)化成不溶性可沉的微生物固體和一部分無機(jī)物,從而使廢水得到凈化。固液分離后的微生物固體是不穩(wěn)定的,一般尚需進(jìn)一步處理或處置。
3.2 影響好氧生物處理的因素
影響好氧生物處理的因素主要是溫度、pH、營養(yǎng)物、供氧、毒物和有機(jī)物性質(zhì)等。
(1)溫度
根據(jù)生長的最適宜溫度范圍,細(xì)菌可分為嗜冷、嗜溫和嗜熱(或可分為低溫、中溫和高溫)三大類。嗜冷菌的最佳生長溫度為4~10℃,嗜熱菌為50~55℃,嗜溫菌為20~40℃,廢水好氧生物處理一般在15~35℃內(nèi)運(yùn)行,溫度低于10℃或高于40℃,去除BOD的效率大大降低,降低。20~30℃效果最佳。一般在5~35℃內(nèi),溫度每增加10~15℃,微生物活動(dòng)能力可增加一倍。
(2)pH
廢水氫離子濃度對(duì)微生物的生長有直接影響。好氧生物處理系統(tǒng)在中性環(huán)境中運(yùn)行最好,一般在pH6.5~8.5范圍內(nèi)。當(dāng)pH>9或pH
(3)供氧
好癢生物處理過程中提供足夠的溶解氧是至關(guān)重要的,供氧不足會(huì)出現(xiàn)厭氧狀態(tài),妨礙好氧微生物正常的代謝過程,并滋長絲狀細(xì)菌。為了使微生物正常代謝和沉淀分離性能良好,一般要求溶解氧維持在2mg/L左右。
(4)營養(yǎng)物
微生物的代謝需要一定比例的營養(yǎng)物質(zhì)。除需要以BOD表示的碳源外,還需要氮、磷和其它微量元素。生活污水含有微生物所需要的各種元素;有些工業(yè)廢水則缺乏某些關(guān)鍵的元素,如氮、磷等,這是就需要透加適量的氮、磷等或生活污水。好氧生物處理對(duì)氮、磷的需要量可根據(jù)下式估計(jì):
(5)有毒物質(zhì)
對(duì)生物處理有毒害的物質(zhì)很多,其中包括重金屬、氰、H2S等無機(jī)物質(zhì)和某些有機(jī)毒物。毒物的毒害作用與pH值、水溫、溶解氧、有無其它毒物及微生物的數(shù)量和是否馴化等有很大關(guān)系。
4.工程調(diào)試進(jìn)程與微生物生長的關(guān)系
4.1 工程調(diào)試初期
廢水接種城市污水處理廠的活性污泥。水中的微生物恢復(fù)活性后,鏡觀好氧池中主要的微生物仍為原城市污水處理中的優(yōu)勢菌體。主要有菌類、原生動(dòng)物和浮游甲殼動(dòng)物等。
4.2 調(diào)試過程中生物相變化
調(diào)試過程中隨著水量的不斷增加和各種外界條件的變化,好氧生物池中的微生物種類和數(shù)量也隨之發(fā)生著變化。通過觀測水中的微生物的這些變化就可以判斷出工程調(diào)試的效果,也可以根據(jù)觀測結(jié)果來對(duì)工程調(diào)試給出指導(dǎo)。
當(dāng)今世界是一個(gè)電的世界。它主宰著這個(gè)世界,支撐著這個(gè)世界,推動(dòng)著這個(gè)世界向前發(fā)展,它是世界發(fā)展的動(dòng)力源頭。人是生活在充滿電的大宇宙之中,作為人體中的每一個(gè)細(xì)胞也是生活和一個(gè)電的環(huán)境中,這就是生物電。細(xì)胞的一切生命活動(dòng),無一不是生物電的作用。人體是由諸多細(xì)胞組成器官,由諸多器官組成系統(tǒng),完成人體極為復(fù)雜的生理功能。
恩格斯早在100年前就說過:“地球上幾乎沒有一種變化發(fā)生而不同時(shí)顯示電現(xiàn)象。”人體更不例外。
1972年美國人布爾用真空管電壓計(jì)在距體表數(shù)毫米處發(fā)現(xiàn)能場,并命名為“生命場”。他說,從低等生物到高等生物都有生命場,測定這個(gè)場可以提前得知這種生物在不久將要發(fā)生的病理變化。這是人類發(fā)現(xiàn)自身電現(xiàn)象具有劃時(shí)代意義的實(shí)驗(yàn)。
1974年英國休倫德博士研究的電場效應(yīng)探知器,不僅可以從4英尺處記錄下人體電場情況,而且還證明身體外部有一個(gè)發(fā)射健康信號(hào)、感情信號(hào)或未知信號(hào)的電場存在。人類身體界限已超出了視覺認(rèn)識(shí),這再一次證明了人體內(nèi)電的存在。
現(xiàn)代電生理學(xué)已明確提出:膜電位、動(dòng)作電位及快慢反應(yīng)電位的概念。細(xì)胞安靜時(shí),膜內(nèi)帶負(fù)電荷,而膜外帶正電荷,形成極化狀態(tài),用微電極測量細(xì)胞內(nèi)外,可產(chǎn)生一個(gè)電位差,稱之為膜電位。當(dāng)細(xì)胞受刺激開始除極時(shí),伴隨除極和復(fù)極進(jìn)行,在細(xì)胞表面出現(xiàn)一個(gè)活動(dòng)的電位變化,稱之為動(dòng)作電位。其電位值為-70~-90毫伏。由于動(dòng)作電位特點(diǎn)又可分為快反應(yīng)電位和慢反應(yīng)電位,并有著不同的生理功能,它們是細(xì)胞生命活動(dòng)的動(dòng)力和基礎(chǔ)。
大量電生理學(xué)的研究資料表明,生物電現(xiàn)象并不是細(xì)胞或器官機(jī)能活動(dòng)的副產(chǎn)品或伴隨物,而是細(xì)胞實(shí)現(xiàn)一些重要機(jī)能的關(guān)鍵或決定因素。例如,軀體的運(yùn)動(dòng)和呼吸動(dòng)作,心臟的射血,一切中空臟器,如胃腸道、膀胱、子宮等內(nèi)臟器官的運(yùn)動(dòng),神經(jīng)化學(xué)遞質(zhì)的釋放,各種酶的活動(dòng),都是以生物電活動(dòng)為基礎(chǔ)。在活動(dòng)之前,首先出現(xiàn)細(xì)胞膜靜息電位,動(dòng)作電位,然后再由膜上的電變化,通過某種偶聯(lián)過程。啟動(dòng)細(xì)胞內(nèi)某些機(jī)構(gòu)表現(xiàn)出如神經(jīng)傳遞、肌肉運(yùn)動(dòng)或腺體分泌等功能。
人類的某些疾病如高血壓病、哮喘病、糖尿病及心腦血管疾病的發(fā)生發(fā)展,都和生物電活動(dòng)失常、細(xì)胞膜離子轉(zhuǎn)運(yùn)障礙有關(guān)。因此。生物電平衡是人體保持健康的基本條件,細(xì)胞生物電失常是人體疾病的根源。細(xì)胞生物電就是細(xì)胞的生命。
如果把人體視為小宇宙,它就是大千世界的大宇宙的縮影,同時(shí)它又比大宇宙更完善、更先進(jìn)。大宇宙沒有解決的科技難點(diǎn)。小宇宙卻莫名其妙地解決得很完善。
基因之小是人所共知的,即使把全世界的人所有的基因合在一起也沒有一個(gè)頂針箍大,它卻能封藏著60億人的各個(gè)特性和500萬年前祖先的遺傳信息,掌管地球上一切生命活動(dòng),這是多么奇特的生命現(xiàn)象。而一切都是在生物電環(huán)境中完成的。
因此,每當(dāng)人們?cè)谔剿饔钪嬗龅綗o法解決的科技難題。不得不向人體小宇宙中學(xué)習(xí),這就形成了所謂“生物物理學(xué)”。比如,波導(dǎo)體研制成功就是向人體學(xué)習(xí)了神經(jīng)傳導(dǎo)多信息不干擾的特性而得到啟迪的。
分析近年來各地的高考試題不難看出,本部分的考點(diǎn)相對(duì)單一,主要就是“細(xì)胞的分化、癌變、衰老和凋亡”的主要特征、形成機(jī)理及其在生產(chǎn)生活、醫(yī)藥衛(wèi)生中的應(yīng)用;而設(shè)置新情境,結(jié)合遺傳學(xué)和選修三知識(shí)背景,要求解釋生產(chǎn)生活中的生物學(xué)現(xiàn)象,如癌細(xì)胞的發(fā)生、控制、治療、衰老現(xiàn)象的產(chǎn)生,細(xì)胞分化、衰老、凋亡與基因表達(dá)的關(guān)系等,則是本部分內(nèi)容在命題時(shí)的一個(gè)顯著特色。
【基礎(chǔ)盤點(diǎn)】
考點(diǎn)一、細(xì)胞分化
1.概念:在個(gè)體發(fā)育中,相同細(xì)胞的后代在形態(tài)、結(jié)構(gòu)和生理功能上發(fā)生穩(wěn)定性差異的過程。
2.過程:受精卵細(xì)胞組織器官系統(tǒng)生物體。
3.結(jié)果:形成形態(tài)、結(jié)構(gòu)和功能都有很大差別的組織和器官。
4.特點(diǎn):持久性、穩(wěn)定性與不可逆轉(zhuǎn)性。
思考:如何理解不可逆轉(zhuǎn)性與脫分化?
已經(jīng)分化為根的細(xì)胞,就不可能再分化為莖細(xì)胞,即為不可逆轉(zhuǎn)性,其前提是要在自然條件下;而在人工條件下,借助現(xiàn)代科技,分化的細(xì)胞能脫分化,從而再回到分化前的狀態(tài),乃至發(fā)育為一個(gè)完整植株(脫分化是指使已分化的細(xì)胞重新回到未分化狀態(tài)的過程)。
5.原因:各種細(xì)胞具有完全相同的遺傳物質(zhì),即攜帶有本物種的全部遺傳信息。
6.實(shí)質(zhì):細(xì)胞中基因的選擇性表達(dá)。遺傳信息的執(zhí)行情況不同,但細(xì)胞內(nèi)的遺傳物質(zhì)不變。
7.畸形分化:極少數(shù)細(xì)胞由于致癌因子的作用,引起基因突變,導(dǎo)致細(xì)胞內(nèi)遺傳物質(zhì)改變,細(xì)胞連續(xù)惡性增殖,最終引起癌變。
8.細(xì)胞的全能性:高度分化的植物細(xì)胞具有全能性,如由胡蘿卜的韌皮部細(xì)胞可培養(yǎng)得到完整植株;高度分化的動(dòng)物細(xì)胞全能性受到抑制,到目前為止,從未由一個(gè)高度分化的動(dòng)物細(xì)胞(生殖細(xì)胞除外)培養(yǎng)得到一個(gè)動(dòng)物體;高度分化的動(dòng)物細(xì)胞的細(xì)胞核仍具全能性,如克隆羊的培育。
考點(diǎn)二、細(xì)胞癌變
1.癌細(xì)胞特征:不受機(jī)體控制、形態(tài)結(jié)構(gòu)發(fā)生改變、細(xì)胞表面發(fā)生變化,易分散轉(zhuǎn)移。
2.癌細(xì)胞形成:致癌因子激活原癌基因,從而使正常細(xì)胞畸形分化為癌細(xì)胞。
3.癌細(xì)胞防治:遠(yuǎn)離致癌因子;手術(shù)+放療+化療。
思考:放療與化療對(duì)身體有哪些不良影響?怎樣處理既可殺滅癌細(xì)胞,又可保護(hù)正常細(xì)胞?據(jù)你所掌握的知識(shí),你認(rèn)為最具發(fā)展?jié)摿Φ目拱┓椒赡苁鞘裁矗?/p>
放療是利用激光與射線直接殺滅癌細(xì)胞;化療是利用化學(xué)藥物阻止癌細(xì)胞DNA分子的復(fù)制,達(dá)到抑制癌細(xì)胞增殖的目的。這些過程抑制癌細(xì)胞的同時(shí),都不可避免地殺死正常細(xì)胞,對(duì)身體的影響非常大。如果用細(xì)胞工程制備的單克隆抗體制成的生物導(dǎo)彈處理癌細(xì)胞(癌細(xì)胞可看成抗原),由于抗原與抗體的特異性,抗體可“直奔”抗原,而抗體上又帶著抗癌藥物,這樣,就不會(huì)影響正常細(xì)胞。癌癥是由原癌基因突變引起,所以,如能阻止原癌基因的表達(dá),則可從根本上達(dá)到抗癌目的。
考點(diǎn)三、細(xì)胞衰老與凋亡
1.細(xì)胞衰老的特征。
“一大”:細(xì)胞核變大,染色質(zhì)固縮、染色加深;“一小”:細(xì)胞內(nèi)水分減少,萎縮變小、細(xì)胞代謝減慢;“一多”:細(xì)胞內(nèi)色素逐漸增多。
2.個(gè)體衰老與細(xì)胞衰老的關(guān)系。
對(duì)單細(xì)胞生物來說,個(gè)體衰老就是細(xì)胞衰老;對(duì)多細(xì)胞生物來說,細(xì)胞的衰老不等于個(gè)體的衰老,如幼年個(gè)體中每天也有細(xì)胞的衰老;機(jī)體的衰老也不等于細(xì)胞的衰老,如老年個(gè)體每天也有新的細(xì)胞產(chǎn)生。當(dāng)個(gè)體衰老時(shí),組成個(gè)體的細(xì)胞往往表現(xiàn)為普遍衰老的現(xiàn)象。
3.細(xì)胞的凋亡。
(1)概念:由基因決定的細(xì)胞自動(dòng)結(jié)束生命的過程。
(2)意義:對(duì)于多細(xì)胞生物體完成正常發(fā)育,維持內(nèi)部環(huán)境的穩(wěn)定,以及抵御外界各種因素的干擾都有非常關(guān)鍵的作用。
(3)細(xì)胞死亡:包括細(xì)胞凋亡和細(xì)胞壞死。細(xì)胞凋亡是細(xì)胞程序性死亡,是正常死亡;細(xì)胞壞死是細(xì)胞在外界因素作用下的死亡,是非正常的細(xì)胞死亡。
【誤區(qū)剖析】
一、細(xì)胞分裂與細(xì)胞分化的區(qū)別
在生物體中,高度分化的細(xì)胞一般不再進(jìn)行細(xì)胞分裂,而分化程度較低的細(xì)胞具有一定的分裂再生能力。只有具備分裂能力的細(xì)胞中才可出現(xiàn)染色體,否則是以染色質(zhì)的形式存在;只有具有大液泡的成熟的植物細(xì)胞才可發(fā)生質(zhì)壁分離。根尖分生區(qū)細(xì)胞分化程度低,細(xì)胞分裂能力強(qiáng),而鱗片葉細(xì)胞為成熟的植物細(xì)胞。
二、細(xì)胞分化與細(xì)胞全能性的區(qū)別
三、細(xì)胞凋亡與細(xì)胞壞死的區(qū)別
神奇的干細(xì)胞
干細(xì)胞是指生物體生命進(jìn)程中出現(xiàn)的一類未分化或未完全分化的細(xì)胞,一旦需要,它可以按照發(fā)育途徑通過分裂而產(chǎn)生分化細(xì)胞。動(dòng)物胚胎干細(xì)胞即為未分化的一類細(xì)胞,應(yīng)在受精卵之后,卵裂與囊胚之前獲得,因?yàn)樵c胚期細(xì)胞已經(jīng)開始分化,成為專能干細(xì)胞。如原腸胚外胚層細(xì)胞將來發(fā)育為表皮及其附屬結(jié)構(gòu)、神經(jīng)系統(tǒng)和感覺器官。現(xiàn)代醫(yī)學(xué)上可運(yùn)用胚胎干細(xì)胞增殖動(dòng)物器官或組織,治療人類疾病。
【典例剖析】
例1.(2013?安徽安慶師范高中模擬卷)研究發(fā)現(xiàn),線粒體促凋亡蛋白Smac是細(xì)胞中一個(gè)促進(jìn)細(xì)胞凋亡的關(guān)鍵蛋白。在正常的細(xì)胞中,Smac存在于線粒體中。當(dāng)線粒體收到釋放這種蛋白質(zhì)的信號(hào)時(shí),就會(huì)將它釋放到線粒體外,然后Smac與凋亡抑制蛋白(IAPs)反應(yīng),促進(jìn)細(xì)胞凋亡。下列有關(guān)敘述不正確的是()
A.Smac從線粒體釋放時(shí)需消耗能量
B.癌細(xì)胞中Smac從線粒體釋放可能受阻
C.癌細(xì)胞的無限增殖,可能與癌細(xì)胞中IAPs過度表達(dá)有關(guān)
D.Smac與IAPs在細(xì)胞凋亡中的作用相同
【解析】Smac屬于大分子物質(zhì),以類似胞吐的方式排出線粒體,因此需消耗能量。由題意可知,Smac從線粒體中釋放出來后與IAPs反應(yīng)才能促進(jìn)細(xì)胞凋亡,所以在癌細(xì)胞中Smac從線粒體中釋放可能受阻。IAPs過度表達(dá)可能與癌細(xì)胞的無限增殖有關(guān)。Smac是線粒體促凋亡蛋白,而IAPs是凋亡抑制蛋白,所以二者在細(xì)胞凋亡中作用相反。
造血干細(xì)胞幼紅細(xì)胞排出細(xì)胞核網(wǎng)織紅細(xì)胞喪失細(xì)胞器成熟紅細(xì)胞凋亡
A.成熟紅細(xì)胞在細(xì)胞呼吸過程中不產(chǎn)生二氧化碳
B.網(wǎng)織紅細(xì)胞仍然能夠合成核基因編碼的蛋白質(zhì)
C.造血干細(xì)胞與幼紅細(xì)胞中基因的執(zhí)行情況不同
D.成熟紅細(xì)胞衰老后控制其凋亡的基因開始表達(dá)
3.細(xì)胞與器官衰老是一種正常的生命現(xiàn)象。無論是細(xì)胞或器官,在衰老過程中不會(huì)出現(xiàn)的是()
A.蛋白質(zhì)合成停止
B.細(xì)胞內(nèi)某些酶的活性減弱,細(xì)胞內(nèi)呼吸速度減慢
C.動(dòng)物細(xì)胞內(nèi)色素增加
D.植物體的衰老器官比幼嫩器官含鉀量高
4.下圖為人體某細(xì)胞所經(jīng)歷的生長發(fā)育各個(gè)階段的示意圖,圖中①~⑦為不同的細(xì)胞,a~c表示細(xì)胞所進(jìn)行的生理過程。下列敘述正確的是()
A.與①相比,②③④的分裂增殖能力加強(qiáng),分化能力減弱
B.⑤⑥⑦的核基因相同,細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)種類和數(shù)量也相同
C.②③④的形成過程中發(fā)生了基因分離和自由組合
D.進(jìn)入c過程的細(xì)胞,酶活性降低,代謝減慢繼而出現(xiàn)凋亡小體
5.近年來,有關(guān)腫瘤細(xì)胞特定分子的靶向治療研究進(jìn)展迅速。研究發(fā)現(xiàn),蛋白X是細(xì)胞膜上的一種受體,由原癌基因X編碼,在一些腫瘤細(xì)胞中,原癌基因X過量表達(dá)會(huì)持續(xù)激活細(xì)胞內(nèi)的信號(hào)傳導(dǎo),啟動(dòng)細(xì)胞DNA的復(fù)制,導(dǎo)致細(xì)胞異常增殖。利用動(dòng)物細(xì)胞融合技術(shù)制備的單克隆抗體,可用于診斷和治療原癌基因X過量表達(dá)的腫瘤。請(qǐng)回答下列問題:
(1)同一個(gè)體各種體細(xì)胞來源于受精卵的分裂與分化。正常情況下,體細(xì)胞核遺傳信息相同的原因是。
(2)通過檢測原癌基因X的和可判斷其是否轉(zhuǎn)錄和翻譯。檢測成人多種正常組織后,發(fā)現(xiàn)原癌基因X只在乳腺、呼吸道等上皮細(xì)胞中有微弱表達(dá),這說明。
(3)根據(jù)以上信息,可推測原癌基因的主要功能是。
(4)制備該單克隆抗體時(shí),免疫動(dòng)物的抗原可以是。B淋巴細(xì)胞識(shí)別抗原并與之結(jié)合,之后在適當(dāng)?shù)男盘?hào)作用下增殖分化為和。
(5)用該單克隆抗體處理原癌基因X過量表達(dá)的某腫瘤細(xì)胞株,發(fā)現(xiàn)其增殖能力明顯下降。這是因?yàn)椤?/p>
6.BAK基因是近年來發(fā)現(xiàn)的一種促凋亡基因,癌細(xì)胞內(nèi)的BAK基因表達(dá)異常。
(1)細(xì)胞凋亡是由決定的細(xì)胞自動(dòng)死亡的過程,對(duì)于多細(xì)胞生物體的正常發(fā)育具有重要意義。