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1、中西醫比較研究。中西醫結合是一門新的綜合性學科，有許多問題還正在探索。正因為在探索的過程中，才有可能創造。中西醫結合這一新興的綜合性學科，在目前有許多不成熟的方面，兩套體系在理論上具有不可通約性，那么，中西醫比較應該是中西醫結合的重要內容。要從兩種醫學不同的文化背景，兩種醫學的源頭及各自形成、發展的歷史過程尤其是兩種醫學的當代形態及其發展趨勢，進行多方位的比較；還要從兩種醫學的不同認知方式和臨床思維進行方法論的比較等等。這種比較有助于對兩種醫學體系特質作深刻的把握，有助于從他者觀點更好地理解自己，從而突出自身優勢以更有效地進行優勢互補和融合，中西醫的比較同時也有助于擴展人們的視野，以推進醫學科學的多元化發展。進行這樣的比較是參與和更新人類生命科學建構的重要途徑。中西醫結合是在當今的全球化時代崛起的，全球化給中西醫結合事業提供了難得的機遇，同時也提出了嚴峻的挑戰。中西醫的比較肩負著中西醫兩套理論體系的對話、溝通的使命，它不僅能在這種對話、溝通過程中啟發人們的思考，努力探索中西醫結合的途徑，探尋中西醫結合的具體運作方式，同時也將對中醫理論的創新和西醫科技發展中的困惑提供不可或缺的借鑒。比較方法已經不再是普通研究中的比較手段，它是全球化時代的一種思維方式用于學術研究的產物。比較學科已成為當代學術研究中最重要的一股力量，它在眾多學科中正在迅速成長為一門“顯學”。從20世紀90年代起，我們就有效地開展了一系列中西醫比較研究。在90年代中后期，我們主編和參編了全國高校統編教材《中西醫學史》以及《醫學科技發展與社會》等，對本科生、研究生分別開設了不同層次的《中西醫比較》選修課。為了進一步廣泛深入地開展中西醫比較研究，目前，我們正在著手編撰《中西醫結合導論》教程。

2、利用多學科的交叉、滲透與融合探索中西醫的結合點。我校是一所融匯西醫、中醫、理工及人文社科于一體的綜合性醫科大學，充分利用多學科的交叉、滲透與融合探索中西醫的結合點，是我們的突出特色和顯著優勢。我們擁有各項配套的設施，積極地利用現代生物醫學科技，促進了中西醫結合的不斷創新與發展。我校的許多國家級、省部級科研項目和重點課題就都是圍繞中西醫結合創新這一目標展開的，并取得一系列豐碩成果。當前，分子生物學已廣泛地滲透到醫學科學研究的各個領域，學科分化越來越細，新的分支學科不斷產生；隨著研究在深度和廣度的發展，各學科廣泛交叉、滲透，新的邊緣學科和交叉科學不斷形成。這些都使人們有可能進一步向細胞、分子以及更深的層次發展，在微觀上日益深入地認識各種疾病以及生命現象的本質。同時，人們認識現象本質的根本目的是為了解決問題，而每一個較大的問題都涉及到若干以至許多方面和領域，特別是現在人們需要解決的問題越來越復雜，因此利用多學科的交叉、滲透與融合探索中西醫的結合點，將有可能成為醫學科學發展突破口，又可以成為新學科的生長點。現代自然科學和技術科學理論和方法與醫學的結合使醫學獲得日趨細微、高效、快速、精密和簡便的手段和技術，從而極大地提高了醫學研究和疾病防治的水平。現代生物醫學科技的不斷發展和廣泛應用，必將揭示中西醫結合防治疾病的作用規律和療效機理，從而推動中西結合在理論上的創新與突破。我們積極利用現代生物醫學科技，充分吸收中醫、西醫兩種醫學特長、發掘、整理研究、闡釋中醫藥學的經驗真知和理論精華，以提高臨床療效和學術水平為核心，以中西醫結合基地建設為基礎，以人才培養為重點，以研究中西醫結合點為主線，積極探索，開拓創新，促進中西醫結合醫學的理論和學科內涵建設不斷向縱深發展。

3、積極探索中醫藥復雜性系統科學研究方法，促進中西醫結合。復雜系統的研究是當代科學的前沿。科學界普遍認為，復雜系統研究目前急需在具體研究領域里取得突破，科學工作者必須在具體的復雜科學問題的研究中應用和發展復雜系統科學的方法論，總結復雜系統運動的一般性規律。復雜系統科學問題與生命科學中大量的關鍵科學問題密切相關。生物，特別是人體，是公認的復雜系統。在現代生物醫學研究中，還原論方法的局限性也已經暴露出來，整體觀的重要性開始被科學界重新認識。而中醫藥理論體系與復雜系統論的思維方式非常相似。人們發現把復雜事物分解為基本組成單元，再用實驗加上分析和推理的方法已經不能夠解決所有的問題。以“還原論”為基礎的西方醫學界由于在解決許多復雜疾病方面一再受到挫折，逐漸出現了循證醫學、系統生物學、系統醫學等新興學科。西方的科學和醫學也開始探求整體論，從而與注重傳統平衡的中醫之間開辟了很多可以對話的渠道。中醫強調整體論，西醫則強調還原論，多年來許多學者認為兩者格格不入，但事實證明，到了系統生物學時代，我們完全有可能找到共同語言。中醫和現代醫學在系統生物學的基礎上進行整合將為醫學的發展帶來革命性的變化。如果能抓住這樣一個趨勢，就有可能創造出一個全新的以認識人體機理為基礎的預防科學體系。所以我們認為，中醫藥與系統生物學結合形成具有我國特色的系統生物醫學，將是一個極富創造性并可能引領中醫藥現代化的重要之舉。在大量的中西醫結合科研實踐中，使我們深刻認識到：中醫藥現代化研究應立足于中醫學基本理論如“證”、“藏象及病機”等整體論，以及中藥復方的多層次、多靶點治療的協同性和“方證”對應性，探索循證中醫學研究的基本方法與可行性途徑，嘗試用“現代語言”詮釋中醫理論的科學性，開展以中醫方劑為載體的“方證相關”內在規律、臨床療效及其作用機制等方面的探索研究，力求在中醫藥基礎和臨床研究的思路與方法上有所創新，在中醫“病－證－方相關性”的基礎研究方面形成特色與優勢，推動現代醫學向預測、預防和個體化的模式轉化并為其提供新的科研思路和方法學，走出一條中西醫結合和中醫藥現代化研究的新路。目前，我們正在著手進行以下幾項工作：一是重視整合和整體性的研究，采用多學科交叉從細胞水平、動物模型、臨床研究等多個層面上開展工作，并要善于將不同層面的研究結果進行整合；二是采用基因組學、蛋白質組學、代謝組學等生物技術進行研究，其中代謝組學由于更能整體性地反映研究對象的病理和生理狀態而將成為一種主要研究手段；三是注重生物信息學，因為數據的整合和整體性、系統性的研究和評價都要借助于生物信息學的應用，中醫生物信息學將在中醫藥現代化研究中扮演重要的角色；四是應積極開展人體微生態包括腸道菌群的代謝和變化的研究，這個領域將在中醫藥現代化研究中成為一個熱點；五是注重中醫理論指導下的復方中藥研究，中藥的研究重點將從單味藥、單體、單個活性部位逐漸轉到復方和合理配伍的活性部位群上來，中藥藥效和臨床療效的評價將出現更能反映整體調控和平衡的新方法和新標準。

4、加強中西醫結合科普創作，拓寬中西醫結合工作的廣度。近年來，我校專家、學者創作了不少中西醫結合的科普作品，在社會上產生了良好的影響。這些作品使廣大群眾初步了解了中西醫結合工作的意義、內容、性質以及中西醫結合的方向和未來。這些作品通俗易懂，切合實用，從中西醫結合角度普及了人類健康衛生和防病治病的科學知識，受到社會大眾熱烈的歡迎。它不僅是中西醫結合工作在面上的擴張，同時也是研究視角多樣化的體現，表征了中西醫結合醫學強大的生命力。